
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物学 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探索最后
论述工人科学探究伴随冷库日子延缓鸡肉的硬性、持反击式水轮机、质感度、自由铁硫含氧量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4质量来测评肌肤公司血神经元的铁死掉的情形。报告屏幕上显示,冷库日子延缓后,鸡肉的硬性在第8天和第6天偏态骤降;持水意识减少;的颜色变深,耗尽质感,鲜鲜颜色变成暗鲜颜色。另外,自由铁、渗透性氧和MDA的硫含氧量偏态加强,血神经元凋亡率偏态增大。 研究分享成员取出的各种不同于冷冻冷藏事件的肌群印刷品的核球血清酶质,那么来进行SDS-PAGE分享,核球血清酶质条带在的各种不同于年代分布区均匀分布且相拟性(图1a)。表明核球血清酶在的各种不同于印刷品中的描述原因,分享出现指定组印刷品的中十位数达到于指定水平方向(图1b),阐明肌群印刷品核球血清酶质都具有顺畅的组内相拟性性和组间差别的性。 淀粉酶质组学共司法技术亲子鉴定出1996种淀粉酶质。以B0为对应组,需求B1、B2、B4和B6中的淀粉酶来之间的关系表答研究介绍,共司法技术亲子鉴定到37几个DEPs。将火山图web3d,并只能根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两只标准研究介绍DEP。最终右图1c-f如图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别司法技术亲子鉴定出22、33、73和140个DEPs,这当中分头别调整6、11、32和8九个,下降16、22、41和53个。聚类分析法的方法分析了各不相同食品冷藏周期全身胸肌集体中淀粉酶质的表答,最终彰显全身胸肌淀粉酶表答之间的关系发生变化保存事件的上升而上升(图1g)。
图1| 不同的冷库时期的肌群土样蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 多种保温日子的力量图纸的差异蛋白酶讲解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身故蛋清肽的PRM化学发光法浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 因为KEGG含有差距形容核蛋白的铁牺牲制度(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT酶联免疫法核苷酸质组学技術保障,拜谱生物工程已研发部顺利完成并确立了完整非常成熟的转录组学、核苷酸组学、分解组学各类两组学协同护肤品技術保障指标体系,欢迎致电咨询!
选取专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.