
2024年9月由常州渔业大学生张万刚老师的团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱海洋生物为该研究提供了亚硝基化遮盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名小标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202多年的影响指数:5.7
刊发精力:2024年9月
雇主公司:南京农业大学
研究分析材质:蛋白
拜谱提供了技术水平:亚硝基化修饰组学
高技术路径:
一、调查后果
01.Caspase-3吸附性
近年尚不了解NO对caspase-3的减弱用处有没归因于NO介导的S-亚硝基化,不相同浓硫酸浓度系数的GSNO对于外源性NO供货,以引发caspase-3的身体外S-亚硝基化。結果表面,与不会有GSNO的组不同之处,100、200和400μM GSNO组的caspase-3灵生物显著性削减(图1),与之前新闻报导同步。GSNO处理削减caspase-3灵生物的意向因为仍迫切需要阐发。
图1 其他质量浓度的GSNO清理对caspase-3活力性的影向
02.Caspase-3的S-亚硝基化层度
理论论述Caspase-3的亚硝基化成度,以系统阐述GSNO对Caspase-3的想法性。经GSNO加工处理后,判断到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化屈服强度提高(图2)。一些没想到证实,外源性GSNO培养出可非常成功诱惑caspase-3的体内S-亚硝基化。最令 惊喜的是,在不会GSNO有着的参考组中判断到其中一个细小的S-亚硝基化带,这证实caspase-3也许 情况内源性的S-亚硝基化。还有就是,本理论论述中caspase-3的S-亚硝基化成度较高,而caspase-3的亲水性有效降低,这与刚刚的理论论述一样。殊不知,caspase-3的非特异朋友S-亚硝基化修饰语位点尚不非常清楚,还必须进三步的探险。
图2 GSNO办理对caspase-3S-亚硝基化技术的决定
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化表达组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。蓝颜色标出的队列说明S-亚硝基化肽,朱红色标出的C说明S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3生物降解结蛋白质
结核血清质是一项更非常重要的血癌细胞骨架核血清质,在保证肌血癌细胞形式的的形式的完正性和膨胀性方便起着更非常重要作用,深入分析S-亚硝基化caspase-3对结核血清质挥发的明情绪化还具备着更非常重要必要性。与Std(未用胱天核血清质酶-3和GSNO孵育的一开始肌棉氯纶核血清质)组不同于,0 μM GSNO组(肌原棉氯纶和caspase-3的孵育,无GSNO)的完正结核血清质纯度不错消减,温馨提示caspase-3对结核血清质还具备着隐藏的的核血清质淀粉水解作用。在GSNO孵育后,完正结核血清质的纯度非常明显加入(P < 0.05)。显然,当GSNO溶度增高时,完正结核血清质的纯度持续时间上浮(P < 0.05)(图5)。这会发现发现,SNO遮盖的caspase-3以关卡根据的方法能够抑制结核血清质的挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3生物降解肌钙血清-T
肌钙球血清-T (TnT)是原肌球球血清调试否则肌群回缩的细细的的需要肌原棉棉纤维素球血清。TnT的溶解特殊性是在线判断到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化条件下,caspase-3对TnT的溶解具体情况如同6下图,与Std组(富含caspase-3和GSNO的肌原棉棉纤维素)好于,caspase-3组中30 kDa TnT片断同质性添加,揭示caspase-3直接参与了TnT的溶解,于此,caspase-3与GSNO的孵育会造成30 kDa TnT增涨。在100和200 μM GSNO组两者如果没有在线判断到同质性的的相互会反应(P > 0.05),而当GSNO的有机废气浓度做到400 μM 时,该片断同质性缩减(P < 0.05)。许多出现 揭示了SNO装饰的caspase-3对TnT溶解的仰开发用。结球血清和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO治理 降底caspase-3的亲水性可能性会造成肌原棉棉纤维素球血清溶解层度降底。综合上面的说明,NO帮助的S-亚硝基化是可以根据装饰半胱氨酸残基来调试caspase-3的亲水性,继而进一次会反应其对结球血清和TnT的球血清溶解业务能力,然后会反应鸡肉的品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋白酶-T
二、个人总结
本学习有何意义浅议S-亚硝基化对caspase-3装饰的应响举例说明其次对牛羊肉肌原玻璃纤维素休外降解塑料的应响。核蛋清质S-亚硝基化可能装饰caspase-3的半胱氨酸残基,而使致使caspase-3吸附性降低,进每一步抑止了其对牛羊肉肌原玻璃纤维素核蛋清质的核蛋清质溶解本事。三、拜谱总结
深入分析应用了酶活深入分析,亚硝基化绘制组学深入分析,WB等论文检测考核机制,挖掘球淀粉酶S-亚硝基化应该绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这导致了caspase-3特异性的消减,相结步骤能够抑制了其对鸡肉肌原食物纤维球淀粉酶的球淀粉酶电离技能。本深入分析为解读球淀粉酶质亚硝基化对吃起来的管控考核机制供应了了个新的层面。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清质组学、绘制血清质组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系统好产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total阳极氧化复原、存在巯基,欢迎大家咨询!
考生文献资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663