
单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力鱼类特情人、寡核苷酸绘制生产成本比较高或工作步骤麻烦。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯专家教授队伍在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个成本分析费用、跨种类、全网络平台兼容的全新解决方案。
期刊杂志详细介绍
Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国的地理学的技术系基因与发育成熟生态学工程学设计所和我国的基因中医药学会举办单位的时代国际科研杂志,坚持创新驱动于报导我的生态学中医药学工程的学和中医药学基因学范畴的全国独特性设计成效。JGG 2025年度影响力系数7.1,Scopus科研杂志品价指标图CiteScore 9.9,名列JCR 2025年度GENETICS & HEREDITY范畴Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY范畴Q1区,名列我国的地理学的技术系杂志系统盘生态学工程学专业类别1区(Top杂志),基因学和血生化与碳原子生态学工程学小类双1区。BIOPROFILE
甚么是HEATag
婉转的“二一体”设计构思
HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成部分的相融合蛋白质
「确定器」板块 - 凝集素
能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化突显(如GlcNAc和Neu5Ac)。
「进行防水连接器」板块 - HUH内切酶
可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引方形码做出共价联接。
“1+1>2”的效率:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样板标记符号与产品追溯。
Fig1: HEATag强有力的加密管控标记符号道理提醒图
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实用技巧测试
HEATag倒底有能开打?
能否在其他先决条件下,达到辅乳哺乳动物神经血细胞系单神经血细胞混样测序
实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。探讨组织为 HEATag 安装了多轮 “压为考试”,从体细胞系系到体细胞系核,从常温下到环境温度,从新鲜样版到固定位置样版,全位置认证它的稳定靠谱性和靠谱性。
弟一波测试仪专门针对母乳喂养家禽受损癌细胞系系:研发技术人员采用了原于人、鼠、仓鼠几个种群的五种受损癌细胞系(HEK293T、K562、MEF、CHO),在常温下要 HEATag 标识后相溶测序。后面收废的 11447 个受损癌细胞系中,85.66% 都能使用 HEATag 长长形码查询合理连接到原种群,模本间交错式空气污染不多,UMAP 聚类算法分析一下也是就直接声明书,HEATag 长长形码查询与种群特异形遗传基因组症状相对高度不符。 继续,检测状况进两步更新升级:科研职工成功在 4℃下箭头最新鲜感血上皮内部系、在制冷下箭头甲醇不变不变血上皮内部系,或是可能直接箭头血上皮内部系核。毕竟早已出众:全部的状况下,范例标识与外来物种资讯均具备挺好的相关联性,拆成更准率超 95%。殊不知甲醇不变不变会导致轻度的转录本穿插影响,血上皮内部系核制作会一点 RNA 因为流失,血上皮内部系类的注脚毕竟早已与最新鲜感范例保证保持一致,证实 HEATag 可能箭头不同的正确处理状况下的实验英文范例。
Fig2: HEATag 可在有差异要求下进行单细胞膜转录组混样分折
就能符号蒲乳期部分动物界和大海无脊柱部分动物界的原代组织
若是说人体细胞核系软件测试是 “根基题”,那集体样板也就是 “扣除题”, 这类样板通常会因人体细胞核分类非常复杂、区域适用性特别,被选为标注枝术的 “疑难问题”,而 HEATag 刚好在这类 “疑难问题” 上展露了优质。研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸机构,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不光能被为准分辨,各个最主要组织结构类型的聚类分析的结果都清淅可辨。
更令人惊喜的是HEATag对大海生物体的兼容性测试性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与动物群转录组具有着较高不对性,没得出现了因高盐生态产生的 “图标不起作用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。
Fig3: HEATag 可进行辅乳植物团队样例丰富 scRNA-seq 解析
Fig4: HEATag可保持新颖海洋能无脊柱爬行动物多个 scRNA-seq 定性分析
HEATag与受损细胞的融入不是引发的转录组的差异性变化
对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在成功图标世界任务的一并,不是对前因后果的转录成分析带来干挠,确定了探析数值的真實性。
Fig5: HEATag不可能印象子样本的 RNA 抒发摸式
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今后可期
HEATag 能为单体细胞钻研造成 什么样的?
HEATag 的使用价值,远不单单于 “解決标上方面”,它的灵敏性和普遍性,已经为单组织设计打开网页非常多会性
从广泛解决方法设计了解
HEATag 能涉及从 “简简单单非常概述”(如癌阻止与通常阻止、制剂解决与对应)到 “大建设的规模设计”(如阻止血组织图谱绘出、高通芯片量建立)的全范围图需求分析。近年来 PIP-seq、Stereo-cell 等新式的可扩充工艺的未来发展,HEATag 还能进那步优化单血组织设计的通量,机械助力教育科研精英团队抓好更好 建设的规模的投资项目。从跨域优势一起来看
HEATag 这不仅选于转录组学,还能与表观遗传基因组学、核膳食纤维组学、空间区域组学等的技術紧密联系,根据拜谱生物数据库索引和寡核苷酸编码序列,HEATag 能能解乏融入到区别的组学过程,不损害4g信号驯服厚度。一并,应用于HEATag还能能发展前景单细胞核糖组学深入分析的技術。BIOPROFILE
合作方式gif动态
拜谱生物技术与陈凯讲解制定系统化相互合作合作意愿
比较适合注意的是,在 HEATag 技術显显现出强大软件前景的背景图下,拜谱怪物学已与南方城市海上环境科学调查与公程深圳调查室(长沙 )陈凯教学获得基本达成合作有意向的客户。两人工作上规划需紧紧围绕 HEATag 技術的加工业化半空、论述转化成等的方向实现角度协同合作,推动这样高效、性价比最高益投入、跨种类的单癌组织记号技術速度更快软件于实际上论述场地,为一些调查室供给高效、性价比最高、社会经济的单癌组织论述APP,电子助力论述工作上者在癌组织怪物学学、海上环境怪物学学、疾病症状长效机制等领域赢得一些推动