
近日,长沙医科高中一是复属醫院王学浩中科院院士团对在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向药物卡路里细胞代谢检测分析服务。
英语怎么说一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
繁体中文版头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客人基层单位:南京医科大学
学习素材:细胞
拜谱给出售后服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶点势能产生组
技术水平路经:
研发报告单
01、YBX1被签别为HCC中糖酵解的重中之重遗传基因
本钻研采集工具HCC淋巴癌症模本(n=7)的单上皮内部系RNA测序统计资料集来确定研究,发掘糖酵解活力性大部分分散在淋巴癌症上皮内部系中,hdWGCNA研究辨识出9个人类基因模组(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的存活研究来确定YBX1为单独存活隐患条件(图1H)。进十步配合IHC、WB实验操作和淋巴癌症集体与相临非淋巴癌症集体的办公空间转录组学统计资料集灵魂存在YBX1是肝上皮内部系癌治愈的隐藏的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判别为可以调节HCC細胞糖酵解的重要影响因素
02、YBX1提高HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗电量细胞代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1整合并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1通过并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷酸性反应,而促使其核转位
进一次检测工具YBX1的O-GlcNAc糖基化会不会影晌其磷碱化,在OGT敲低的HCC生殖血细胞中或用OGT遏药物OSMI-1外理,YBX1球蛋清酶的质量偏态削减,YBX1磷碱化偏态削减(图4A-C)。IP调查呈现,在类似的Flag-YBX1底物的质量下,YBX1-WT的磷碱化的质量偏态大于YBX1-T57A,取决于磷碱化的多不单仅是为了越高的YBX1球蛋清酶表述出来(图4D)。分割了核和质混合物得知TMG外理的HCC生殖血细胞中YBX1核表述出来的提高(图4E-F),进一次得知YBX1磷碱化的重要调控指数公式是AKT(图4G-I)。一些得知更加注重O-GlcNAc糖基化在推动其磷碱化来强化YBX1球蛋清酶安全性并推动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制语有帮助于其进第一步情况磷碱化绘制语并就能够推动其核转位
05、YBX1增强PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1驱动PKM2转录
06、YBX1 都可以提高自己组核蛋白乳过酸呈现标准
科学研究显示YBX1敲低明显减少核营养素乳酸性反应,非常是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解克药品2-DG的科学试验否认了糖酵解与组核球蛋白乳酸性反应的会绑定qq,克制糖酵解可明显减少H3K18la技术(图6D)。PKM2过理解出不可逆转转YBX1敲低形成的H3K18la下调,之外源乳酸工作不增加H3K18la,还随着YBX1理解出调涨,提醒存有正在向上报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR否认,H3K18la按照聚集于YBX1进行子会加快其转录,该步骤受O-GlcNAc糖基化调节作用(图6H-J),并显示P300 调涨是YBX1增強H3K18乳酰凝成用的规则(图6K-L)。
图6.YBX1不断增强H3K18乳碱化装饰质量
一篇文章个人心得体会
在这般深入分析中新闻报道了YBX1在HCC中高表现,以及与糖酵解秘切有关的。YBX1在T57处被O-GlcNAc表达语,以此平稳蛋清质并激发其表现。这般表达语还带动YBX1在T57处的磷碱化,带动其核易位。因而,某一方式激发了糖酵解有关的DNA的转录并多种多样乳酸的出现。与此同时,YBX1重置P300的转录,于是驱动器组蛋清的乳碱化,格外是H3K18la,H3K18乳碱化正在向改善YBX1DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因正反面馈环系统图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物工程为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点能力产生组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、全文翻译后装饰组学、新陈代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参阅学术论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.