拜谱生物

400-820-8531
News center
拜谱生物
首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 无线网络药学学论述草酸钙肾结石氧化物应激状态和宫颈炎症伤到规则

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设计最喜欢见的急病中之一。肾组识中CaOx结晶体过趋于稳定导致沉积会引起肾小管細胞板材损害和凋亡,于是引起肾结石的导致。短链皮下碳水化合物酸由可以使肠胃内活性污泥法真菌发孝合理膳食弹性纤维生产,往往在局布可以使肠胃防御装置中发挥用出功效,况且在设计技术上也发挥用出根本功效。各举,丁酸是最多的短链皮下碳水化合物酸,更具消除炎症和免疫细胞治理和改善功效,本论述研究丁酸对CaOx肾结石的功效和存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院门诊泌尿产科吴忠研究生生导师、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家、周子健院士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了互联网药学学产品,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

小文章名称大全:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 消费者的单位:华山医院口腔科 设计项目:大鼠、HK-2神经细胞 分组名资讯:照表组(Con)、沙盘模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱具备系统:网药学学测量

总体目标过程图

研究方案导致

探讨方案成员先在校园营销推广活动的环节之中所构建大鼠沙盘整治,利用生理变化血生化公式和组织结构疾病学脱色等探讨方案行为发现丁酸可能才能减少CaOx沙盘整治大鼠肾CaOx结晶体的建立和板材损害,改进CaOx沙盘整治大鼠的感染板材损害和腐蚀成分的过多表述。还有就是,丁酸还可仰制草酸诱导型的HK-2上皮上皮细胞板材损害、腐蚀应激反应和上皮上皮细胞凋亡。 为实验设计丁酸设计特征和靶什么是染色体系统动态统计资料,研究了解工作人员从PubChem收集丁酸和丁酸酯的二维和二维设计特征(图1A)。采用PharmMapper动态统计资料表和Uniprot动态统计资料表处置后共选择出117个丁酸靶什么是染色体供进十步了解。将什么是染色体目录加入STRING动态统计资料表,开展PPI系统动态统计资料了解。Cytoscape列出了顺序排列的前20的交通核心靶什么是染色体的具体系统动态统计资料图,包含CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。许多交通核心什么是染色体与系统动态统计资料中的各种光于的什么是染色体均特征出务必的各种光于的系数,说明怎么写许多什么是染色体很有应该起着协同作战用。GO和KEGG了解体现了丁酸交通核心什么是染色体的各种光于的前提条件和生物工程工程学工作(图1C)。交通核心什么是染色体最最主要的与类固醇激素类类回应、氧化物不起功能应激性状态回应、特异性氧肿瘤细胞对类固醇激素类类激发的不起功能包括对强酸耐腐蚀产物的不起功能光于。上述上述,许多交通核心什么是染色体最最主要的参与到了氧化物不起功能应激性状态和对特异性氧的生物工程工程不起功能进程,是肾结石出现原则中至关很重点的前提条件,这呈现丁酸很有应该在肾结石中起很重点用。

图1| 丁酸设计与靶DNA网上定量分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一步明确骤探秘丁酸对CaOx肾结石真的切靶dna组,科研人士凭借GEO大参数库文件对GSE73680中安全照表与CaOx肾结石提高的dna组文化差异对其使用了科研。照表组与CaOx结石提高的重要性系数性文化差异理解dna组(DEGs)选择标准单位为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个dna组的发生重要性系数发生改变,另外3379个(89.4%)dna组理解上涨,404个(10.6%)dna组理解调整(图2A)。对DEGs对其使用聚类算法浅析浅析,热图提示了前10个被选中DEGs的二维分层现象聚类算法浅析表现(图2B)。马上又,科研人士用GeneCards大参数库文件人工控制签别了370个能够与CaOx肾结石重要性的dna组,排在前20位的推测dna组举例说明重要性性评估如同2C如图。成了找寻到丁酸改善CaOx肾结石的重点靶点,科研人士将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石重要性dna组治理 达到一堆个Venn图。不可能,CYP2C9被知道为丁酸应响CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。不仅如此,科研人士还对其使用了丁酸与CYP2C9的碳原子交接,CYP2C9的二个氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接目的,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在使用网格临床药理学予测CYP2C9是丁酸损害CaOx肾结石的靶DNA后,调查人工还可以通过神经元科学试验否认了CYP2C9可减低草酸引导的HK-2神经元的ROS标准、炎症病变挫伤和凋亡。

图2| 基本上据库整合研究分析分析预测CYP2C9是丁酸角色于CaOx肾结石的靶什么是基因

科研报告

本探索先发觉丁酸在休内和休内均能减缓CaOx肾结石仿真模型的被空气氧化应激反应反应和发炎问题,继而凭借在线药学学建立能够丁酸影向CaOx肾结石的内在的靶点——CYP2C9,后面凭借体生殖细胞测试可确认CYP2C9在草酸盐促进的HK-2体生殖细胞ROS水准、发炎问题和凋亡。他们发觉得出结论丁酸有可能凭借减缓CYP2C9来减缓CaOx肾结石的被空气氧化应激反应反应,减缓发炎问题。相应流程中拜谱动物学作为了在线药学学技能保障,除外拜谱动物学可提高了成长期完整的基因组组学、蛋白质含量质组学、消化吸收组学等多个学类产品及技能保障,欢迎语拨打电话咨询服务! 对比文章:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物