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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核动物学mRNA中最猛要的转录后突显,在真核动物学的病理学和生理上时中起着至关很重要的功能。痛风社会认知心里障碍也是种不可逆反应的脑神经末梢脑神经整体退行性的疾病,目前为止发展趋势真的切管理机制没有截然说明,还有就是缺乏性合理有效的防冶和疗法技术手段。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生态学为其提供m6A甲基化分折高技术精准服务,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

优秀文章名稱:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

潜在客户机关单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

探索文件:小鼠脑组织

拜谱提供数据工艺:m6A甲基化(MeRIP-seq)

内容提要图:

图1| 文献综述图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

学习后果

1.DCI小鼠海马中m6A人类基因掩盖的转变

实验专业师关键在于开发了高脂饮食营养和群体行为性障碍(DCI)的小鼠沙盘模型。为好于参考组(n = 3)和DCI组(n = 3)内的m6ADNA修饰语,实验专业师用到MeRIP-seq来进行了转录组标准内的m6A-seq定量分析。在DCI组的10664个代码DNA转录物(mRNAs)里还察觉参考组的23715-7个不偏移的m6A峰。好于后,DCI组突出表现出23,755-7个非偏移m6A峰。另外,9345-7个甲基化DNA在参考组和DCI组内偏移(图2)。

图2| 比组和DCl组m6a绘制遗传基因的维恩图

共鉴定费出127九个对比分享甲基化的m6A位点(DMMSs),另外60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化级别各是为取得高与剖析组。分享其布局情况下发觉m6A峰布局在这个RNA中(图3A),并跟据其布局的转录领域有下列五组:5'UTR、3'UTR、转录起止位点领域段落、终结解锁登陆帐号密码子段落、起止解锁登陆帐号密码子段落和商品编号队列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和终结解锁登陆帐号密码子周围为取得含有(图3B)。关键在于评价指标这个遗传遗传基因上m6A淡化的领域,论述人需求了有峰注脚的领域,并旋光度的测定了这个遗传遗传基因上reads的遮盖率。在DCI组中,m6A淡化区摇摆不定于3'UTR区(图3C)。拥有mRNA内的DMMS都被准确定位到固色体进行评价指标其布局简介。有差异 小鼠固色体的m6A淡化谱有差异 。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的更改

从而检测m6A绘制在DCI小鼠中的菌物学基本功能,深入解析员工从三组下选择有效DMMS的球氨基酸识别码dna确定GO和KEGG解析(图4A)。在GO解析中,高甲基化dna在肿瘤上皮癌体细胞整个整个的时候、菌物整个整个的时候管控、离子液体剂的作用吸附性和杂环类类类化合物通过中显著性性含有。KEGG预警手机电磁波通道解析彰显,高甲基化dna与T肿瘤上皮癌体细胞多巴胺蛋白激酶预警预警手机电磁波通道、小肿瘤上皮癌体细胞癌症和RIG-I样多巴胺蛋白激酶预警预警手机电磁波通道相关内容(图4B)。面对低甲基化dna,GO解析彰显在肿瘤上皮癌体细胞整个整个的时候、分泌整个整个的时候和通过整个整个的时候中显著性性含有生物碳环类类类化合物、通过杂环类类类化合物和离子液体剂的作用吸附性(图4C)。KEGG预警手机电磁波通道解析阐明了低甲基化dna与肥厚性心肌病和Hippo预警预警手机电磁波通道的绑定(图4D)。

图4| 一定的差异甲基化m6A位点的信号通路丰度

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据统计的联动介绍

接着随后钻研师将m6A MeRIP-Seq的统计资料和仍然RNA-Seq的统计资料做联办探讨,出现163个mRNA,m6A峰和mRNA技术不错改善。41种mRNA的m6A和mRNA技术上涨,14种mRNA技术再降。除此之外,30个染色体mRNA把你想表达爱出来上涨,m6A技术再降,76个染色体mRNA把你想表达爱出来再降,m6A技术上涨(图5A)。还有,引入好几回个PPI网洛来凸显163个染色体识别码的血清之間的接入(图5B)。

如下图下图6下图,GO和KEGG讲解划分四组:(1) m6A上涨,mRNA再降;(2) m6A上涨,mRNA上涨;(3) m6A再降,mRNA再降;(4) 遗传染色体遗传m6A再降和mRNA上涨。在GO讲解中,m6A上涨和mRNA再降的遗传染色体遗传在脑神经元核基础产生阶段、清香族有机物生物工程聚合阶段和RNA基础产生阶段的监测中有明显聚集。KEGG讲解提示 ,这类遗传染色体遗传在碳水化合物的酸基础产生、小脑神经元核肺癌患者、丙酸基础产生和甲苯酸基础产生中聚集。相对于m6A上涨和mRNA上涨的遗传染色体遗传,GO讲解提示 在亚铁组合、亚胺丙氨酸脱羧酶渗透性、天冬氨酸1-脱羧酶渗透性和脑神经元核接触拼装负监测中聚集;KEGG讲解提示 在2型糖尿病的风险、碳水化合物的脑神经元核成分表现通道和胰岛素表现通道中聚集。在GO讲解中,m6A再降和mRNA再降的遗传染色体遗传在寡肽组合、谷胱甘肽组合和二硫防化合物防硫化重置酶渗透性中聚集,而在KEGG讲解中,他们在青柠檬酸配置(TCA配置)、丙酸基础产生和多鱼类凋亡中聚集。在GO讲解中,m6A再降和mRNA上涨的遗传染色体遗传在胚胎骨骨节特征引发、蛋清激酶渗透性缴活和NADP基础产生阶段中聚集,在KEGG讲解中,m6A再降和mRNA上涨遗传染色体遗传在新霉素、卡那霉素和脑神经各种营养成分摄入成分表现通道中聚集。

图5| m6A甲基化与mRNA表达出的合力阐述

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG阐述

拜谱生物学总结ppt

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物制品提供了m6A甲基化的技术的服务,拜谱生物工程可提供完善成熟的核蛋白组学、细胞代谢组学、转录组学包括两组学连合食品技术水平功能,欢迎致电咨询!

借鉴学术论文:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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