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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 品牌分享|乳酸性反应的实现逆袭弟兄,衣康酸性反应体现核蛋白组强硬新一波!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一支为纸业配料而被熟记的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“代谢转化有害垃圾”是“藏宝图小氧分子”的苦不堪言路程类同,等你近十几种年才被察觉到其关键的生物技术学功能性,如果有一天“坐起农奴把唱歌”,尤为是在免疫抗体感染病变性问题钻研的领域内与时共进。有几篇职称论文报到了在种种感染病变性问题的動物模型工具中索取衣康酸或其生物学表达延伸物技术的调理益处,并察觉到其内在的靶点。观于衣康酸的“下一世”与“今生今世”,具体情况见文案《乳酸的奋斗史兄弟们——衣康酸!本文陪我明白衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸表达球蛋白组学产品,实现1000+高妙度表达位点查出,稳定性高逆转径典靶点,全地方生信概述解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“出现 ”到“查证”全的流程服务管理,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、研究步骤流程

02、亲测数据源

03、经“点”逆转

在评测数据文件中,查出多条学术论文中新闻的非常经典靶点试述衣康酸突显位点,如1、个被看到的衣康酸共价突显血清KEAP1,还糖酵解信号通路中的3个要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体组建血清NLRP3和神经元病变进程中的要点血清RIPK3等,其质谱图以下图如图是。

04、企业产品亮点

1.众多质控

工业化特异形测试探针孵育、SDS-PAGE检查测量、WB核实、范例有关于性定性分析等双方向检查测量,为了保证大型项目结杲耐用性。

2.高机械性能质谱测量仪器品台

在Orbitrap Astral全新这一代高辩别质谱仪金刚萨垛下,达到衣康酸性反应绘制位点及蛋白酶签别新进一步,注力数学调查新显示。

3.全方法站台式售后服务

对于拜谱生物工程加强的进行实验品台,可给出“组织细胞训练→探头孵育→WB在线检侧→玄妙度衣康过酸表达在线检侧→专享生信数据分析→指定位点PRM检验”全程序流程保障,省时省劲更实惠。

05、进行分析主要内容(这部分)

06、利用方法

PART 2、论文共享

专著一

英文翻译一级标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

常常标题格式:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

科学研究內容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

医学文献二

日语一级标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

英文版一级标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研发知识:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例案发展工作思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13包括较弱的底物联系力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康过酸表达组监测参数中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用遮盖(以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

身为TCA不断循环中的间基础消化吸收物,衣康酸的调节基础消化吸收、免役和支原体感染区间内的相互之间功效,为诊治免役支原体感染性疾患给予了方式诊治攻略 。衣康酸设备构造中的亲电性α,β-不饱和羧酸设备构造能对核胆固醇上的抗逆性半胱氨酸残基做出烷基化装饰(迈克尔加的不良反应),一项译为后装饰被称之为“衣康酸装饰(itaconation)”,随之导致核胆固醇功能模块,监测免役回复和基础消化吸收方法,为三种疾患口服药物创新给予新基本思路。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化体现核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医疗可以说 化学发光法靶向药物产生组(QMT1000)或卡路里基础基础代谢靶向疗法基础基础代谢组产品设备对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

决定性资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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